cas-bigdatalab/piflow/bdbe-homo

Claude Code and agent skill by cas-bigdatalab/piflow

Trust tier 2
  • community
LLM review pending
Source check pending

Checking that the SKILL.md file is still in the repository.

根据多维度筛选条件检索单细胞测序相关的预训练数据集，支持分页查询，返回符合条件的数据集详情，并格式化展示查询结果。

Install

npx vskill@latest install cas-bigdatalab/piflow/bdbe-homo

SKILL.md

The same SKILL.md was published earlier as majiayu000/claude-skill-registry/bdbe-homo.

bdbe_homo Skill

功能描述

根据多维度筛选条件检索单细胞测序相关的预训练数据集，支持分页查询，返回符合条件的数据集详情，并格式化展示查询结果。

核心功能

  • 支持多维度筛选条件（生物物种、组织/器官、分类、时间、性别等）
  • 支持分页查询
  • 格式化展示查询结果
  • 处理长结果输出

参数说明

  • organism：生物物种（必填参数）
  • organ：组织/器官（可选）
  • class：分类（可选）
  • time：发育/采样时间（可选）
  • gender：性别（可选）
  • cell_line：细胞系（可选）
  • organoid：类器官（可选）
  • tumor：肿瘤相关（可选）
  • page_num：分页页码（从1开始，默认1）
  • page_size：每页返回数据集数量（默认10）

依赖

  • requests
  • json

使用示例

基本使用
bash
python scripts/bdbe_homo.py --organism "Acomys cahirinus"
带筛选条件
bash
python scripts/bdbe_homo.py --organism "Acomys cahirinus" --organ "ear" --page_num 1 --page_size 5

输入输出示例

输入
bash
python scripts/bdbe_homo.py --organism "Acomys cahirinus"
输出
查询结果：
总数据集数量: 5
 
数据集 1:
- ID: 62385
- 唯一标识: KUN00100200008268
- 样本编号: GSM5519177
- 生物物种: Acomys cahirinus
- 分类: organ
- 组织/器官: ear
- 细胞系: not applicable
- 发育/采样时间: Adult
- 性别: not applicable
- 系列编号: GSE182141
- 原始数据量: 8559
- 质控后数据量: 8148
- 注释后数据量: 8148
- 数据文件路径: scope/Mouse/GSM5519177_prepared.h5ad
- 数据授权类型: open access
- 测序平台: 10x
 
页码: 1, 每页数量: 10

注意事项

  • organism参数为必填项
  • 所有参数支持模糊/精准匹配，空值表示不筛选该维度
  • 如果结果过长，会自动输出到临时文件并读取展示
  • 响应状态码为0表示检索成功，非0为异常

Security

  • Security scanPassed, 100 of 100Pattern checks on the skill's files.
  • Model reviewNot runA model review is scheduled for the next rescan.

See the full security report

Quality evaluation

  • Task evaluationNot runNo evaluation yet. Run one in Skill Studio.

See evaluation results

Source

Popularity

7-day trend score
0

Not refreshed yet.

Works with

Any agent vskill installs to: 56 targets in all. These 39 have a page on this site.

  • Claude Code
  • Cursor
  • GitHub Copilot
  • Windsurf
  • Codex
  • Gemini CLI
  • Cline
  • Amp
  • Roo Code
  • Goose
  • Continue
  • Kilo Code
  • Junie
  • Trae
  • OpenHands
  • Qwen Code
  • AI Agent
  • Tabnine Chat
  • Sourcegraph Cody
  • Amazon Q
  • Firebase Genkit
  • Sweep
  • Devin
  • Phind
  • Mentat
  • Claude Desktop
  • Aider
  • GPT Pilot
  • Plandex
  • bolt.new
  • v0
  • Replit Agent
  • Anse
  • TypingMind
  • BetterChatGPT
  • LibreChat
  • Warp AI
  • Pieces
  • Fig AI
Embed badge
vskill VERIFIED badge
[![vskill VERIFIED](https://verified-skill.com/api/v1/skills/cas-bigdatalab/piflow/bdbe-homo/badge)](https://verified-skill.com/skills/cas-bigdatalab/piflow/bdbe-homo)

Something wrong with this skill or its page? Tell us.