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Skill v1.0.0

currentAutomated scan100/100
cas-bigdatalab/piflow/chemdb-search
──Details
PublishedOctober 26, 2026 at 01:03 AM
Content Hashsha256:853a297c73eafc89...
Git SHAad8d0108a54a
──Files
Files (1 file, 5.8 KB)
SKILL.md5.8 KBactive
SKILL.md · 137 lines · 5.8 KB

version: "1.0.0" name: chemdb_search description: 用于检索化学物质详细信息的技能。当用户希望检索化学物质详细信息、查看化学物质详细信息、检索化学物质基础数据库等情况时触发。该技能通过输入化学分子式(必要参数)以及分页(可选参数)、分页大小(可选参数)调用外部化学物质基础数据库搜索服务,并按字段含义格式化展示查询结果以及SVG化学分子式结构。 compatibility:

  • python
  • requests

name_zh: 用于检索化学物质详细信息的技能算子 input_params:

  • name: text

type: string required: true description: 化学分子式(如 C6H6、C12H12)

  • name: page

type: int required: false default: 1 description: 分页页码(从1开始)

  • name: page_size

type: int required: false default: 10 description: 每页返回的化学物质数量

output_params:

  • name: search_result

type: json_file description: 化学物质详细信息JSON,包含化学物质列表、分子结构(SVG)等 tag: 科学计算 publisher: COMMUNITY


chemdb_search 技能

功能说明

该技能用于调用化学物质基础数据库搜索服务,根据用户输入的化学分子式检索并返回对应的化学物质详细信息,展示时按json字段含义格式化展示并将image字段的 SVG 数据可直接渲染为分子结构示意图,便于直观查看物质结构。

触发条件

当用户希望:

  • 检索化学物质详细信息
  • 查看化学物质详细信息
  • 检索化学物质基础数据库
  • 查询特定化学分子式的物质信息
  • 获取化学物质的详细属性

调用服务说明

化学物质基础数据库搜索服务

该接口来自 化学物质基础数据库([chemdb.csdb.cn](https://chemdb.csdb.cn)),核心功能是根据输入的化学分子式(如 C6H6、C12H12),检索并返回对应的化学物质详细信息,支持分页查询。

接口核心信息

1. 基础配置

  • 服务名称:化学物质分子式检索服务
  • 接口地址:http://www.chemdb.csdb.cn/chemdb_backend/search/text_search
  • 请求方式:GET
  • 响应状态:成功返回 200,message 为 "success"

2. 请求参数(URL 参数)

参数名说明示例值必填
text检索关键词(需为化学分子式)C6H6是
page分页页码(从 1 开始)1否
page_size每页返回的化学物质数量10否

3. 响应数据结构(核心字段说明)

响应为 JSON 格式,核心包含data(化学物质列表)和分页相关字段:

一级字段说明
data化学物质详细信息列表(数组)
page_all总页数
total匹配的化学物质总数量
code响应状态码(200 = 成功)
message响应信息(成功返回 "success")
data数组中单个化学物质的关键字段
字段名说明示例值
Formula化学分子式(与检索关键词一致)C6H6
MolWeight分子量78.11184
Alias_en英文别名1,4-Hexadiyne
CASCAS 编号(化学物质唯一标识)10420-91-4
SMILES简化分子线性输入规范(分子结构编码)C#CCC#CC
IUPAC_NameIUPAC 标准命名hexa-1,4-diyne
InChI国际化学标识符(分子结构唯一标识)InChI=1S/C6H6/c1-3-5-6-4-2/h1H,5H2,2H3
InChiKeyInChI 的哈希值(便于检索)NJXXWBJAOFKNIR-UHFFFAOYSA-N
image分子结构示意图(SVG 格式)包含 SVG 标签的矢量图数据

使用方法

  1. 调用 scripts/chemdb_search.py 脚本
  2. 提供必要参数 text(化学分子式)
  3. 可选择提供参数 page(分页页码)和 page_size(每页大小)
  4. 脚本将返回接口的完整 JSON 响应

输出格式

按查询结果json的每一条字段的含义属性格式化展示查询结果,并将image字段的 SVG 数据可直接渲染为分子结构示意图,便于直观查看物质结构。

补充说明

  1. 检索范围:仅支持化学分子式检索(如 C6H6、C12H12),输入其他类型关键词可能无匹配结果;
  2. 数据完整性:返回的化学物质信息涵盖分子结构、命名、标识、分子量等核心属性,满足化学研究、物质识别等场景需求;
  3. 分页机制:通过page和page_size控制返回数量,示例中检索 C6H6 共匹配 1244 条结果,分 125 页展示;
  4. 分子结构可视化:image字段的 SVG 数据可直接渲染为分子结构示意图,便于直观查看物质结构。

示例

示例 1:检索 C6H6 的化学物质信息

bash
python scripts/chemdb_search.py --text C6H6

示例 2:检索 C12H12 的化学物质信息,指定分页参数

bash
python scripts/chemdb_search.py --text C12H12 --page 2 --page_size 20

错误处理

  • 如果未提供必要参数 text,脚本将提示错误并退出
  • 如果接口调用失败,脚本将返回错误信息
  • 如果网络连接失败,脚本将提示网络错误
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