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Claude Code and agent skill by jschen-biostat/math-modelcn

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完备严谨的统计学数据预处理流程(默认 R 语言,无 R 时可降级为"生成可本地运行脚本"或 Python 分支)。支持两种模式:完整全流程(10 步)或轻量局部模式(只执行用户指定的若干步骤)。10 步:分布探查→描述统计与交叉表→数据清洗(缺失/异常/一致性)→数据变换(防泄漏)→变量编码与重赋值→衍生变量与分组分层→平稳性检验(非时序跳过)→多重共线性与降维→数据集划分→结果验证。每步输出代码、配图、UTF-8 with BOM CSV;阈值(VIF>10、|偏度|>1)为默认值、可由用户覆盖;关键决策点(异常取舍、缺失填补方案)会暂停与用户确认。本技能是底层业务工具,可由 math-modeling 内部按需加载;仅做局部清洗/编码等单步处理或明确要求 Python 时按轻量模式执行,避免与 math-modeling 同时顶层触发两套流程。

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SKILL.md

数据预处理(R 语言)Skill

模式分支(先判断模式,再执行)

  1. 全流程模式(FULL):系统性预处理 + EDA + 论文预处理章节(建模竞赛、统计毕设)→ 执行全部 10 步。
  2. 轻量模式(LOCAL):用户只做局部任务(仅清洗缺失 / 仅变量编码 / 仅降维 / 仅划分…)→ 只执行指定步骤,不强制完整流水线、不生成全套交付物;交付物开头声明"已按轻量模式仅执行第 N 步:……"。
  3. 脚本交付模式(SCRIPT_ONLY):运行环境无 R(或用户不想在本环境运行)→ 生成完整可本地运行的 R 脚本 + 运行说明,不在 Agent 内强行执行;明确声明"未在本环境运行,请本地运行后回传结果"。
  4. Python 分支:用户明确要求 Python → 同一 10 步骨架改用 pandas/sklearn,交付物注明"Python 实现"。
默认 FULL。用户语言含"只/仅/简单/先处理一下/帮我清洗/帮我编码"等局部意图时自动切 LOCAL,不询问、不暂停。
与 math-modeling 的关系:本技能是底层业务工具。math-modeling 收到完整建模任务时由它内部按需加载本技能;用户在完整建模流程之外单独要数据预处理时才由本技能直接触发。二者不要同时顶层激活(避免两套工作流打架)。

10 步大纲

  1. 数据分布情况(直方图、箱线图等)
  2. 描述性统计与交叉表
  3. 数据清洗(缺失值、异常值、一致性)
  4. 数据变换(按需,防泄漏)
  5. 变量编码与重赋值(重命名)
  6. 构造衍生变量与分组分层
  7. 平稳性检验与时间序列预处理(非时序可跳过,须说明)
  8. 多重共线性检验及降维
  9. 数据集划分(如需)
  10. 验证处理结果
每步完整细节(目标/必做动作/R 代码要点/配图/表格/场景依据/验收/决策点)见 references/preprocess-detail.md——开始执行前必须实际读取该文件,不得凭记忆执行。

交付契约

  1. scripts/data_preprocess_full.R —— 以 scripts/preprocess_template.R 模板为基础定制的完整可运行脚本,每步分区 + 中文注释;轻量模式只含执行步骤。
  2. 数据预处理_R代码全流程.md —— 按步分节粘贴代码(每节前写"本步目标与场景依据"一行)。
  3. 数据预处理_图解读与论文写法.md —— 全部图片逐一解读(图号/文件名/标题/核心结论/关键数值)+ "可直接放入论文的数据预处理章节"(数字必须与运行结果一致)。
  4. results/数据预处理结果/*.csv —— 全部 UTF-8 with BOM,禁止乱码。
  5. figures/数据预处理/ —— 每步至少 1 图,PNG 300 dpi + SVG。
  6. 轻量模式按实际执行步骤缩减交付物,每项产物与执行步骤一一对应,不得凭空多出未执行步骤的产物。

顶层硬规则

  1. 输入文件只读;全部产物写入 PROJECT_ROOT,禁止覆盖输入。
  2. 路径配置:任何需用户按本机情况配置的路径必须用 # ===== 用户可配置区 ===== 标注,并给出默认自动探测逻辑(不依赖手填路径也能跑)。
  3. 图片:统一出版级样式(theme_bw + 中文字体、网格弱化、标题居中加粗、图例规范);每图含"图号+标题+前/后对比(适用时)";禁止默认灰底、禁止乱码。
  4. 每一步必须写明选用方法的场景依据;"按需/可选/跳过"必须给出明确理由,不能省略不解释。
  5. 防泄漏红线:变换参数、标准化、PCA、插补模型一律"训练集拟合、验证/测试集映射",代码注释明示。
  6. 阈值默认可覆盖:VIF>10、|偏度|>1、IQR×1.5、MAD×3 等均为默认值;不同领域可覆盖,交付物写明"默认阈值 + 实际采用值 + 覆盖理由"。
  7. 交互停顿:关键决策点(缺失填补方案、异常删除/保留、是否降维、划分方式)必须暂停并询问用户确认;无法交互时明确记录假设与决策依据,交付时列为"待用户确认项"。
  8. 环境降级:无 R → 脚本交付模式或 Python 分支,不得静默改用其他语言冒充已运行;缺包给出安装命令。
  9. 完成前逐项核对自检清单(见 references/preprocess-detail.md 末节),并如实报告核对结果。

渐进加载指引

  • 触发后只读本文件与 references/preprocess-detail.md(执行流程细节);
  • 写脚本时先读取 scripts/preprocess_template.R 模板再定制,禁止每次从零生成大段 R 代码;
  • 其余参考资料按需读取,不要一次性加载。

Security

  • Security scanPassed, 100 of 100Pattern checks on the skill's files.
  • Model reviewNot runA model review is scheduled for the next rescan.

Quality evaluation

  • Task evaluationNot runNo evaluation yet. Run one in Skill Studio.

Source

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